Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC153Q494R4 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC153Q494R4 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC153Q494R4 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC153Q494R4 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC153Q494R4 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC153Q494R4 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC153Q494R4 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC153Q494R4 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC153Q494R4 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC153Q494R4 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC153Q494R4 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC153Q494R4 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC153Q494R4 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC153Q494R4 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC153Q494R4 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC153Q494R4 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC153Q494R4 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC153Q494R4 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC153Q494R4 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC153Q494R4 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC153Q494R4 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC153Q494R4 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC153Q494R4 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC153Q494R4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC153Q494R4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC153Q494R4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC153Q494R4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC153Q494R4 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC153Q494R4 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC153Q494R4 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC153Q494R4 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC153Q494R4 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC153Q494R4 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC153Q494R4 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC153Q494R4 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC153Q494R4 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC153Q494R4 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC153Q494R4 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC153Q494R4 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC153Q494R4 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC153Q494R4 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC153Q494R4 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC153Q494R4 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC153Q494R4 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC153Q494R4 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC153Q494R4 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC153Q494R4 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC153Q494R4 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC153Q494R4 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC153Q494R4 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC153Q494R4 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC153Q494R4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC153Q494R4 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC153Q494R4 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC153Q494R4 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC153Q494R4 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC153Q494R4 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC153Q494R4 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC153Q494R4 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC153Q494R4 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC153Q494R4 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC153Q494R4 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC153Q494R4 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC153Q494R4 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC153Q494R4 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC153Q494R4 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC153Q494R4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC153Q494R4 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC153Q494R4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC153Q494R4 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC153Q494R4 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC153Q494R4 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC153Q494R4 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC153Q494R4 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC153Q494R4 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC153Q494R4 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC153Q494R4 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC153Q494R4 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC153Q494R4 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC153Q494R4 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC153Q494R4 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC153Q494R4 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC153Q494R4 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC153Q494R4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC153Q494R4 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC153Q494R4 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC153Q494R4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC153Q494R4 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC153Q494R4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC153Q494R4 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC153Q494R4 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC153Q494R4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC153Q494R4 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC153Q494R4 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC153Q494R4 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC153Q494R4 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC153Q494R4 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC153Q494R4 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC153Q494R4 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms