Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SP6Q3SY56 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SP6Q3SY56 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms