Protein–RNA interactions for Protein: Q3MHD2

LSM12, Protein LSM12 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM12Q3MHD2 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
LSM12Q3MHD2 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms