Protein–RNA interactions for Protein: Q2V2M9

FHOD3, FH1/FH2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHOD3Q2V2M9 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
FHOD3Q2V2M9 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC32.1■■■□□ 2.73
FHOD3Q2V2M9 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
FHOD3Q2V2M9 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC32.1■■■□□ 2.73
FHOD3Q2V2M9 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
FHOD3Q2V2M9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
FHOD3Q2V2M9 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
FHOD3Q2V2M9 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
FHOD3Q2V2M9 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
FHOD3Q2V2M9 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
FHOD3Q2V2M9 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
FHOD3Q2V2M9 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
FHOD3Q2V2M9 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
FHOD3Q2V2M9 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
FHOD3Q2V2M9 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
FHOD3Q2V2M9 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
FHOD3Q2V2M9 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
FHOD3Q2V2M9 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
FHOD3Q2V2M9 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
FHOD3Q2V2M9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
FHOD3Q2V2M9 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
FHOD3Q2V2M9 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC32.09■■■□□ 2.73
FHOD3Q2V2M9 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
FHOD3Q2V2M9 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
FHOD3Q2V2M9 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC32.09■■■□□ 2.73
FHOD3Q2V2M9 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
FHOD3Q2V2M9 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
FHOD3Q2V2M9 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
FHOD3Q2V2M9 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
FHOD3Q2V2M9 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
FHOD3Q2V2M9 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
FHOD3Q2V2M9 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
FHOD3Q2V2M9 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
FHOD3Q2V2M9 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
FHOD3Q2V2M9 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
FHOD3Q2V2M9 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.73
FHOD3Q2V2M9 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
FHOD3Q2V2M9 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
FHOD3Q2V2M9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
FHOD3Q2V2M9 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
FHOD3Q2V2M9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
FHOD3Q2V2M9 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
FHOD3Q2V2M9 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
FHOD3Q2V2M9 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
FHOD3Q2V2M9 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
FHOD3Q2V2M9 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
FHOD3Q2V2M9 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
FHOD3Q2V2M9 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
FHOD3Q2V2M9 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
FHOD3Q2V2M9 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
FHOD3Q2V2M9 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
FHOD3Q2V2M9 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
FHOD3Q2V2M9 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
FHOD3Q2V2M9 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
FHOD3Q2V2M9 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
FHOD3Q2V2M9 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
FHOD3Q2V2M9 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
FHOD3Q2V2M9 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
FHOD3Q2V2M9 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
FHOD3Q2V2M9 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
FHOD3Q2V2M9 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
FHOD3Q2V2M9 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
FHOD3Q2V2M9 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
FHOD3Q2V2M9 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
FHOD3Q2V2M9 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC32.05■■■□□ 2.72
FHOD3Q2V2M9 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC32.05■■■□□ 2.72
FHOD3Q2V2M9 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
FHOD3Q2V2M9 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC32.05■■■□□ 2.72
FHOD3Q2V2M9 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
FHOD3Q2V2M9 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
FHOD3Q2V2M9 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
FHOD3Q2V2M9 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
FHOD3Q2V2M9 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
FHOD3Q2V2M9 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
FHOD3Q2V2M9 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
FHOD3Q2V2M9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
FHOD3Q2V2M9 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
FHOD3Q2V2M9 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
FHOD3Q2V2M9 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
FHOD3Q2V2M9 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
FHOD3Q2V2M9 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
FHOD3Q2V2M9 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
FHOD3Q2V2M9 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
FHOD3Q2V2M9 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
FHOD3Q2V2M9 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
FHOD3Q2V2M9 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
FHOD3Q2V2M9 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
FHOD3Q2V2M9 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
FHOD3Q2V2M9 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
FHOD3Q2V2M9 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
FHOD3Q2V2M9 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
FHOD3Q2V2M9 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
FHOD3Q2V2M9 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
FHOD3Q2V2M9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
FHOD3Q2V2M9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
FHOD3Q2V2M9 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
FHOD3Q2V2M9 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
FHOD3Q2V2M9 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
FHOD3Q2V2M9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
FHOD3Q2V2M9 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms