Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC27Q2M243 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC27Q2M243 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC27Q2M243 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC27Q2M243 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC27Q2M243 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC27Q2M243 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC27Q2M243 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC27Q2M243 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC27Q2M243 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC27Q2M243 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC27Q2M243 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC27Q2M243 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC27Q2M243 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC27Q2M243 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC27Q2M243 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC27Q2M243 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC27Q2M243 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC27Q2M243 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC27Q2M243 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC27Q2M243 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC27Q2M243 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC27Q2M243 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC27Q2M243 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC27Q2M243 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC27Q2M243 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC27Q2M243 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC27Q2M243 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC27Q2M243 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC27Q2M243 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC27Q2M243 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC27Q2M243 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC27Q2M243 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC27Q2M243 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC27Q2M243 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC27Q2M243 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC27Q2M243 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC27Q2M243 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC27Q2M243 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC27Q2M243 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC27Q2M243 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC27Q2M243 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC27Q2M243 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC27Q2M243 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC27Q2M243 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC27Q2M243 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC27Q2M243 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC27Q2M243 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC27Q2M243 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC27Q2M243 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC27Q2M243 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC27Q2M243 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC27Q2M243 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC27Q2M243 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC27Q2M243 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC27Q2M243 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC27Q2M243 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC27Q2M243 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC27Q2M243 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC27Q2M243 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC27Q2M243 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC27Q2M243 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC27Q2M243 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC27Q2M243 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC27Q2M243 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC27Q2M243 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC27Q2M243 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC27Q2M243 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC27Q2M243 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC27Q2M243 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC27Q2M243 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC27Q2M243 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC27Q2M243 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC27Q2M243 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC27Q2M243 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC27Q2M243 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC27Q2M243 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC27Q2M243 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC27Q2M243 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC27Q2M243 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC27Q2M243 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC27Q2M243 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC27Q2M243 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC27Q2M243 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC27Q2M243 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC27Q2M243 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC27Q2M243 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC27Q2M243 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC27Q2M243 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC27Q2M243 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC27Q2M243 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC27Q2M243 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC27Q2M243 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC27Q2M243 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC27Q2M243 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC27Q2M243 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC27Q2M243 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC27Q2M243 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC27Q2M243 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC27Q2M243 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms