Protein–RNA interactions for Protein: Q2KHR2

RFX7, DNA-binding protein RFX7, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX7Q2KHR2 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFX7Q2KHR2 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFX7Q2KHR2 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFX7Q2KHR2 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFX7Q2KHR2 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFX7Q2KHR2 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFX7Q2KHR2 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFX7Q2KHR2 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFX7Q2KHR2 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RFX7Q2KHR2 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RFX7Q2KHR2 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RFX7Q2KHR2 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RFX7Q2KHR2 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RFX7Q2KHR2 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RFX7Q2KHR2 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RFX7Q2KHR2 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RFX7Q2KHR2 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RFX7Q2KHR2 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RFX7Q2KHR2 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RFX7Q2KHR2 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RFX7Q2KHR2 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RFX7Q2KHR2 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RFX7Q2KHR2 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RFX7Q2KHR2 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RFX7Q2KHR2 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RFX7Q2KHR2 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RFX7Q2KHR2 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFX7Q2KHR2 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFX7Q2KHR2 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFX7Q2KHR2 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFX7Q2KHR2 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFX7Q2KHR2 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFX7Q2KHR2 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFX7Q2KHR2 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFX7Q2KHR2 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFX7Q2KHR2 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFX7Q2KHR2 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFX7Q2KHR2 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFX7Q2KHR2 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFX7Q2KHR2 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFX7Q2KHR2 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFX7Q2KHR2 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFX7Q2KHR2 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFX7Q2KHR2 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFX7Q2KHR2 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFX7Q2KHR2 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFX7Q2KHR2 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFX7Q2KHR2 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFX7Q2KHR2 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RFX7Q2KHR2 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RFX7Q2KHR2 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFX7Q2KHR2 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFX7Q2KHR2 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RFX7Q2KHR2 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFX7Q2KHR2 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFX7Q2KHR2 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFX7Q2KHR2 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFX7Q2KHR2 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFX7Q2KHR2 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFX7Q2KHR2 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFX7Q2KHR2 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFX7Q2KHR2 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFX7Q2KHR2 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFX7Q2KHR2 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFX7Q2KHR2 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFX7Q2KHR2 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RFX7Q2KHR2 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFX7Q2KHR2 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFX7Q2KHR2 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFX7Q2KHR2 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFX7Q2KHR2 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFX7Q2KHR2 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFX7Q2KHR2 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFX7Q2KHR2 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFX7Q2KHR2 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFX7Q2KHR2 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFX7Q2KHR2 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFX7Q2KHR2 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFX7Q2KHR2 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFX7Q2KHR2 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFX7Q2KHR2 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFX7Q2KHR2 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFX7Q2KHR2 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFX7Q2KHR2 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFX7Q2KHR2 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFX7Q2KHR2 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFX7Q2KHR2 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFX7Q2KHR2 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFX7Q2KHR2 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFX7Q2KHR2 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFX7Q2KHR2 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RFX7Q2KHR2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RFX7Q2KHR2 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RFX7Q2KHR2 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RFX7Q2KHR2 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RFX7Q2KHR2 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RFX7Q2KHR2 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RFX7Q2KHR2 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RFX7Q2KHR2 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RFX7Q2KHR2 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms