Protein–RNA interactions for Protein: Q29980

MICB, MHC class I polypeptide-related sequence B, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICBQ29980 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MICBQ29980 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MICBQ29980 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MICBQ29980 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MICBQ29980 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MICBQ29980 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MICBQ29980 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MICBQ29980 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MICBQ29980 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MICBQ29980 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MICBQ29980 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MICBQ29980 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MICBQ29980 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MICBQ29980 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MICBQ29980 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MICBQ29980 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MICBQ29980 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MICBQ29980 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MICBQ29980 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MICBQ29980 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MICBQ29980 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MICBQ29980 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MICBQ29980 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MICBQ29980 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MICBQ29980 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MICBQ29980 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MICBQ29980 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MICBQ29980 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MICBQ29980 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MICBQ29980 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
MICBQ29980 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
MICBQ29980 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MICBQ29980 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MICBQ29980 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MICBQ29980 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MICBQ29980 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MICBQ29980 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MICBQ29980 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MICBQ29980 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MICBQ29980 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MICBQ29980 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
MICBQ29980 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MICBQ29980 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MICBQ29980 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MICBQ29980 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MICBQ29980 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MICBQ29980 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MICBQ29980 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MICBQ29980 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MICBQ29980 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MICBQ29980 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MICBQ29980 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MICBQ29980 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MICBQ29980 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MICBQ29980 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MICBQ29980 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MICBQ29980 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MICBQ29980 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MICBQ29980 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MICBQ29980 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MICBQ29980 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MICBQ29980 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MICBQ29980 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MICBQ29980 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MICBQ29980 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MICBQ29980 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MICBQ29980 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MICBQ29980 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
MICBQ29980 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MICBQ29980 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MICBQ29980 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MICBQ29980 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MICBQ29980 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MICBQ29980 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
MICBQ29980 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
MICBQ29980 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
MICBQ29980 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MICBQ29980 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MICBQ29980 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MICBQ29980 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MICBQ29980 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MICBQ29980 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MICBQ29980 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MICBQ29980 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MICBQ29980 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MICBQ29980 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MICBQ29980 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MICBQ29980 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MICBQ29980 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MICBQ29980 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MICBQ29980 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MICBQ29980 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MICBQ29980 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MICBQ29980 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MICBQ29980 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MICBQ29980 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MICBQ29980 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MICBQ29980 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MICBQ29980 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MICBQ29980 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms