Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 827 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SKIDA1Q1XH10 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.3■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SKIDA1Q1XH10 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
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