Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KNOP1Q1ED39 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KNOP1Q1ED39 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KNOP1Q1ED39 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KNOP1Q1ED39 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KNOP1Q1ED39 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KNOP1Q1ED39 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KNOP1Q1ED39 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KNOP1Q1ED39 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KNOP1Q1ED39 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KNOP1Q1ED39 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KNOP1Q1ED39 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KNOP1Q1ED39 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KNOP1Q1ED39 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KNOP1Q1ED39 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KNOP1Q1ED39 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KNOP1Q1ED39 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KNOP1Q1ED39 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KNOP1Q1ED39 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KNOP1Q1ED39 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KNOP1Q1ED39 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
KNOP1Q1ED39 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KNOP1Q1ED39 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KNOP1Q1ED39 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KNOP1Q1ED39 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KNOP1Q1ED39 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KNOP1Q1ED39 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KNOP1Q1ED39 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KNOP1Q1ED39 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KNOP1Q1ED39 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KNOP1Q1ED39 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KNOP1Q1ED39 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KNOP1Q1ED39 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KNOP1Q1ED39 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KNOP1Q1ED39 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KNOP1Q1ED39 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KNOP1Q1ED39 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KNOP1Q1ED39 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KNOP1Q1ED39 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KNOP1Q1ED39 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KNOP1Q1ED39 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KNOP1Q1ED39 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KNOP1Q1ED39 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KNOP1Q1ED39 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KNOP1Q1ED39 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KNOP1Q1ED39 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KNOP1Q1ED39 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KNOP1Q1ED39 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KNOP1Q1ED39 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KNOP1Q1ED39 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KNOP1Q1ED39 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KNOP1Q1ED39 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KNOP1Q1ED39 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KNOP1Q1ED39 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KNOP1Q1ED39 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KNOP1Q1ED39 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KNOP1Q1ED39 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KNOP1Q1ED39 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KNOP1Q1ED39 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KNOP1Q1ED39 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KNOP1Q1ED39 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KNOP1Q1ED39 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KNOP1Q1ED39 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KNOP1Q1ED39 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KNOP1Q1ED39 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KNOP1Q1ED39 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KNOP1Q1ED39 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KNOP1Q1ED39 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KNOP1Q1ED39 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KNOP1Q1ED39 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KNOP1Q1ED39 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KNOP1Q1ED39 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KNOP1Q1ED39 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KNOP1Q1ED39 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KNOP1Q1ED39 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KNOP1Q1ED39 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KNOP1Q1ED39 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KNOP1Q1ED39 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KNOP1Q1ED39 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KNOP1Q1ED39 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KNOP1Q1ED39 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KNOP1Q1ED39 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KNOP1Q1ED39 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KNOP1Q1ED39 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KNOP1Q1ED39 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KNOP1Q1ED39 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KNOP1Q1ED39 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KNOP1Q1ED39 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KNOP1Q1ED39 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KNOP1Q1ED39 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KNOP1Q1ED39 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KNOP1Q1ED39 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KNOP1Q1ED39 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KNOP1Q1ED39 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KNOP1Q1ED39 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KNOP1Q1ED39 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KNOP1Q1ED39 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KNOP1Q1ED39 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KNOP1Q1ED39 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KNOP1Q1ED39 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
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