Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LAMA3Q16787 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LAMA3Q16787 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LAMA3Q16787 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LAMA3Q16787 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LAMA3Q16787 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LAMA3Q16787 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LAMA3Q16787 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LAMA3Q16787 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LAMA3Q16787 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LAMA3Q16787 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMA3Q16787 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMA3Q16787 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMA3Q16787 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMA3Q16787 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMA3Q16787 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMA3Q16787 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMA3Q16787 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMA3Q16787 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMA3Q16787 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMA3Q16787 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMA3Q16787 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMA3Q16787 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMA3Q16787 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMA3Q16787 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMA3Q16787 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMA3Q16787 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMA3Q16787 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMA3Q16787 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMA3Q16787 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMA3Q16787 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMA3Q16787 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMA3Q16787 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMA3Q16787 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMA3Q16787 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMA3Q16787 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMA3Q16787 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMA3Q16787 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMA3Q16787 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMA3Q16787 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMA3Q16787 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMA3Q16787 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMA3Q16787 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMA3Q16787 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMA3Q16787 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMA3Q16787 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMA3Q16787 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMA3Q16787 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMA3Q16787 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMA3Q16787 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMA3Q16787 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMA3Q16787 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMA3Q16787 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMA3Q16787 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMA3Q16787 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMA3Q16787 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMA3Q16787 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMA3Q16787 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMA3Q16787 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMA3Q16787 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMA3Q16787 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMA3Q16787 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMA3Q16787 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMA3Q16787 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMA3Q16787 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMA3Q16787 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMA3Q16787 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMA3Q16787 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMA3Q16787 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMA3Q16787 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMA3Q16787 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMA3Q16787 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMA3Q16787 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMA3Q16787 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMA3Q16787 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMA3Q16787 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMA3Q16787 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMA3Q16787 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMA3Q16787 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMA3Q16787 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMA3Q16787 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMA3Q16787 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMA3Q16787 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMA3Q16787 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMA3Q16787 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
LAMA3Q16787 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
LAMA3Q16787 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
LAMA3Q16787 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
LAMA3Q16787 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
LAMA3Q16787 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LAMA3Q16787 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LAMA3Q16787 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LAMA3Q16787 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
LAMA3Q16787 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LAMA3Q16787 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LAMA3Q16787 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LAMA3Q16787 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LAMA3Q16787 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
LAMA3Q16787 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LAMA3Q16787 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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