Protein–RNA interactions for Protein: Q16623

STX1A, Syntaxin-1A, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX1AQ16623 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
STX1AQ16623 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
STX1AQ16623 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
STX1AQ16623 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
STX1AQ16623 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
STX1AQ16623 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
STX1AQ16623 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
STX1AQ16623 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
STX1AQ16623 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
STX1AQ16623 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
STX1AQ16623 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
STX1AQ16623 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
STX1AQ16623 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
STX1AQ16623 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
STX1AQ16623 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
STX1AQ16623 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
STX1AQ16623 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
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STX1AQ16623 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
STX1AQ16623 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
STX1AQ16623 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
STX1AQ16623 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
STX1AQ16623 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
STX1AQ16623 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
STX1AQ16623 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
STX1AQ16623 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
STX1AQ16623 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
STX1AQ16623 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
STX1AQ16623 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
STX1AQ16623 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
STX1AQ16623 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
STX1AQ16623 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
STX1AQ16623 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
STX1AQ16623 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
STX1AQ16623 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
STX1AQ16623 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
STX1AQ16623 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
STX1AQ16623 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
STX1AQ16623 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
STX1AQ16623 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
STX1AQ16623 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
STX1AQ16623 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
STX1AQ16623 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
STX1AQ16623 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
STX1AQ16623 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
STX1AQ16623 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
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STX1AQ16623 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
STX1AQ16623 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
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STX1AQ16623 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
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STX1AQ16623 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
STX1AQ16623 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
STX1AQ16623 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
STX1AQ16623 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
STX1AQ16623 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
STX1AQ16623 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
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STX1AQ16623 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
STX1AQ16623 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
STX1AQ16623 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
STX1AQ16623 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
STX1AQ16623 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
STX1AQ16623 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
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STX1AQ16623 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
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STX1AQ16623 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
STX1AQ16623 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
STX1AQ16623 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
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STX1AQ16623 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
STX1AQ16623 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
STX1AQ16623 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
STX1AQ16623 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
STX1AQ16623 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
STX1AQ16623 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
STX1AQ16623 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
STX1AQ16623 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
STX1AQ16623 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
STX1AQ16623 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
STX1AQ16623 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
STX1AQ16623 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
STX1AQ16623 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
STX1AQ16623 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
STX1AQ16623 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
STX1AQ16623 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
STX1AQ16623 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
STX1AQ16623 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
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