Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

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Length 822 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NTRK2Q16620 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NTRK2Q16620 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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