Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF239Q16600 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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