Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHRNA6Q15825 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
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