Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HMGN3Q15651 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMGN3Q15651 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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