Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRADDQ15628 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRADDQ15628 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRADDQ15628 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRADDQ15628 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRADDQ15628 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRADDQ15628 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRADDQ15628 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TRADDQ15628 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRADDQ15628 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRADDQ15628 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRADDQ15628 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRADDQ15628 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRADDQ15628 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRADDQ15628 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRADDQ15628 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRADDQ15628 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRADDQ15628 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRADDQ15628 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRADDQ15628 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRADDQ15628 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRADDQ15628 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRADDQ15628 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRADDQ15628 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRADDQ15628 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TRADDQ15628 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TRADDQ15628 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TRADDQ15628 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
TRADDQ15628 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TRADDQ15628 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TRADDQ15628 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRADDQ15628 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
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