Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDGFRLQ15198 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PDGFRLQ15198 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDGFRLQ15198 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDGFRLQ15198 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDGFRLQ15198 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDGFRLQ15198 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDGFRLQ15198 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDGFRLQ15198 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDGFRLQ15198 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDGFRLQ15198 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDGFRLQ15198 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDGFRLQ15198 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDGFRLQ15198 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDGFRLQ15198 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDGFRLQ15198 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDGFRLQ15198 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDGFRLQ15198 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDGFRLQ15198 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDGFRLQ15198 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDGFRLQ15198 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDGFRLQ15198 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDGFRLQ15198 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDGFRLQ15198 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
PDGFRLQ15198 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDGFRLQ15198 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
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