Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
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PRKD1Q15139 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PRKD1Q15139 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PRKD1Q15139 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PRKD1Q15139 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PRKD1Q15139 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PRKD1Q15139 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PRKD1Q15139 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
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