Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
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BRD3Q15059 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRD3Q15059 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
BRD3Q15059 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BRD3Q15059 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BRD3Q15059 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
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BRD3Q15059 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BRD3Q15059 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BRD3Q15059 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
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BRD3Q15059 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BRD3Q15059 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BRD3Q15059 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
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BRD3Q15059 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BRD3Q15059 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BRD3Q15059 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BRD3Q15059 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.32■■□□□ 1
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BRD3Q15059 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BRD3Q15059 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BRD3Q15059 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
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BRD3Q15059 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
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BRD3Q15059 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BRD3Q15059 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BRD3Q15059 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BRD3Q15059 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BRD3Q15059 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BRD3Q15059 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BRD3Q15059 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BRD3Q15059 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BRD3Q15059 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BRD3Q15059 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BRD3Q15059 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BRD3Q15059 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BRD3Q15059 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BRD3Q15059 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BRD3Q15059 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BRD3Q15059 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.31■■□□□ 1
BRD3Q15059 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BRD3Q15059 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BRD3Q15059 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BRD3Q15059 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BRD3Q15059 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BRD3Q15059 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BRD3Q15059 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BRD3Q15059 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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