Protein–RNA interactions for Protein: Q14CN2

CLCA4, Calcium-activated chloride channel regulator 4, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA4Q14CN2 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CLCA4Q14CN2 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CLCA4Q14CN2 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CLCA4Q14CN2 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CLCA4Q14CN2 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CLCA4Q14CN2 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CLCA4Q14CN2 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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