Protein–RNA interactions for Protein: Q14684

RRP1B, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1BQ14684 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RRP1BQ14684 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RRP1BQ14684 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RRP1BQ14684 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RRP1BQ14684 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RRP1BQ14684 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RRP1BQ14684 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RRP1BQ14684 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RRP1BQ14684 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RRP1BQ14684 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RRP1BQ14684 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RRP1BQ14684 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RRP1BQ14684 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RRP1BQ14684 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RRP1BQ14684 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RRP1BQ14684 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RRP1BQ14684 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RRP1BQ14684 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RRP1BQ14684 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RRP1BQ14684 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RRP1BQ14684 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RRP1BQ14684 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RRP1BQ14684 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RRP1BQ14684 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RRP1BQ14684 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RRP1BQ14684 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RRP1BQ14684 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RRP1BQ14684 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RRP1BQ14684 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RRP1BQ14684 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RRP1BQ14684 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RRP1BQ14684 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RRP1BQ14684 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RRP1BQ14684 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RRP1BQ14684 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RRP1BQ14684 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RRP1BQ14684 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RRP1BQ14684 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RRP1BQ14684 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RRP1BQ14684 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RRP1BQ14684 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RRP1BQ14684 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RRP1BQ14684 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RRP1BQ14684 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RRP1BQ14684 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RRP1BQ14684 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RRP1BQ14684 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RRP1BQ14684 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RRP1BQ14684 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RRP1BQ14684 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RRP1BQ14684 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RRP1BQ14684 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RRP1BQ14684 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RRP1BQ14684 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RRP1BQ14684 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RRP1BQ14684 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RRP1BQ14684 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
RRP1BQ14684 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RRP1BQ14684 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RRP1BQ14684 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RRP1BQ14684 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RRP1BQ14684 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RRP1BQ14684 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RRP1BQ14684 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RRP1BQ14684 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RRP1BQ14684 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RRP1BQ14684 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RRP1BQ14684 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RRP1BQ14684 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RRP1BQ14684 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RRP1BQ14684 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RRP1BQ14684 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RRP1BQ14684 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RRP1BQ14684 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RRP1BQ14684 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RRP1BQ14684 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RRP1BQ14684 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RRP1BQ14684 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RRP1BQ14684 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RRP1BQ14684 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RRP1BQ14684 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RRP1BQ14684 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RRP1BQ14684 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RRP1BQ14684 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RRP1BQ14684 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RRP1BQ14684 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RRP1BQ14684 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RRP1BQ14684 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RRP1BQ14684 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RRP1BQ14684 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RRP1BQ14684 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RRP1BQ14684 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RRP1BQ14684 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RRP1BQ14684 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RRP1BQ14684 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RRP1BQ14684 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RRP1BQ14684 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RRP1BQ14684 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RRP1BQ14684 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RRP1BQ14684 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms