Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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SEMA3AQ14563 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA3AQ14563 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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