Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SCARB2Q14108 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCARB2Q14108 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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