Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
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COL9A2Q14055 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
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COL9A2Q14055 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
COL9A2Q14055 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
COL9A2Q14055 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
COL9A2Q14055 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
COL9A2Q14055 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
COL9A2Q14055 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
COL9A2Q14055 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
COL9A2Q14055 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
COL9A2Q14055 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
COL9A2Q14055 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
COL9A2Q14055 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
COL9A2Q14055 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
COL9A2Q14055 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
COL9A2Q14055 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
COL9A2Q14055 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
COL9A2Q14055 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
COL9A2Q14055 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
COL9A2Q14055 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
COL9A2Q14055 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
COL9A2Q14055 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
COL9A2Q14055 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
COL9A2Q14055 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
COL9A2Q14055 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
COL9A2Q14055 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
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