Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COL4A6Q14031 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COL4A6Q14031 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COL4A6Q14031 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COL4A6Q14031 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COL4A6Q14031 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COL4A6Q14031 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COL4A6Q14031 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
COL4A6Q14031 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COL4A6Q14031 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COL4A6Q14031 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COL4A6Q14031 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COL4A6Q14031 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
COL4A6Q14031 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COL4A6Q14031 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
COL4A6Q14031 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
COL4A6Q14031 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COL4A6Q14031 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
COL4A6Q14031 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
COL4A6Q14031 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
COL4A6Q14031 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COL4A6Q14031 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COL4A6Q14031 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COL4A6Q14031 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COL4A6Q14031 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COL4A6Q14031 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COL4A6Q14031 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COL4A6Q14031 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COL4A6Q14031 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COL4A6Q14031 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COL4A6Q14031 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
COL4A6Q14031 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COL4A6Q14031 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COL4A6Q14031 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COL4A6Q14031 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
COL4A6Q14031 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COL4A6Q14031 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COL4A6Q14031 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COL4A6Q14031 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COL4A6Q14031 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COL4A6Q14031 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COL4A6Q14031 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
COL4A6Q14031 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
COL4A6Q14031 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
COL4A6Q14031 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
COL4A6Q14031 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
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COL4A6Q14031 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COL4A6Q14031 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COL4A6Q14031 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COL4A6Q14031 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COL4A6Q14031 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COL4A6Q14031 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COL4A6Q14031 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COL4A6Q14031 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COL4A6Q14031 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COL4A6Q14031 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COL4A6Q14031 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COL4A6Q14031 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COL4A6Q14031 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COL4A6Q14031 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
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COL4A6Q14031 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COL4A6Q14031 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COL4A6Q14031 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COL4A6Q14031 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COL4A6Q14031 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
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COL4A6Q14031 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
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COL4A6Q14031 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
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COL4A6Q14031 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
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COL4A6Q14031 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COL4A6Q14031 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
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COL4A6Q14031 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
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COL4A6Q14031 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COL4A6Q14031 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COL4A6Q14031 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COL4A6Q14031 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COL4A6Q14031 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COL4A6Q14031 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COL4A6Q14031 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COL4A6Q14031 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COL4A6Q14031 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COL4A6Q14031 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COL4A6Q14031 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COL4A6Q14031 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COL4A6Q14031 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COL4A6Q14031 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
COL4A6Q14031 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COL4A6Q14031 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
COL4A6Q14031 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COL4A6Q14031 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COL4A6Q14031 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COL4A6Q14031 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
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