Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2H3Q13889 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GTF2H3Q13889 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GTF2H3Q13889 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GTF2H3Q13889 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
GTF2H3Q13889 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GTF2H3Q13889 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GTF2H3Q13889 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GTF2H3Q13889 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GTF2H3Q13889 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2H3Q13889 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2H3Q13889 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2H3Q13889 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2H3Q13889 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2H3Q13889 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2H3Q13889 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2H3Q13889 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2H3Q13889 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2H3Q13889 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2H3Q13889 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2H3Q13889 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2H3Q13889 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2H3Q13889 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2H3Q13889 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2H3Q13889 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2H3Q13889 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2H3Q13889 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2H3Q13889 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2H3Q13889 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2H3Q13889 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2H3Q13889 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2H3Q13889 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2H3Q13889 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2H3Q13889 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2H3Q13889 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2H3Q13889 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2H3Q13889 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2H3Q13889 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2H3Q13889 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2H3Q13889 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2H3Q13889 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
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