Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
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TUBA3CQ13748 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
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TUBA3CQ13748 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TUBA3CQ13748 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
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