Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NAE1Q13564 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NAE1Q13564 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NAE1Q13564 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NAE1Q13564 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NAE1Q13564 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NAE1Q13564 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NAE1Q13564 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
NAE1Q13564 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NAE1Q13564 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NAE1Q13564 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NAE1Q13564 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NAE1Q13564 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NAE1Q13564 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NAE1Q13564 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NAE1Q13564 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NAE1Q13564 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NAE1Q13564 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NAE1Q13564 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NAE1Q13564 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NAE1Q13564 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
NAE1Q13564 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
NAE1Q13564 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NAE1Q13564 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NAE1Q13564 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NAE1Q13564 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NAE1Q13564 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NAE1Q13564 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NAE1Q13564 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NAE1Q13564 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NAE1Q13564 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
NAE1Q13564 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NAE1Q13564 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
NAE1Q13564 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NAE1Q13564 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NAE1Q13564 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
NAE1Q13564 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NAE1Q13564 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NAE1Q13564 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NAE1Q13564 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NAE1Q13564 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NAE1Q13564 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NAE1Q13564 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NAE1Q13564 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NAE1Q13564 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NAE1Q13564 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NAE1Q13564 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NAE1Q13564 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NAE1Q13564 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NAE1Q13564 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NAE1Q13564 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NAE1Q13564 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NAE1Q13564 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
NAE1Q13564 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NAE1Q13564 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NAE1Q13564 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NAE1Q13564 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
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NAE1Q13564 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NAE1Q13564 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NAE1Q13564 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NAE1Q13564 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
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NAE1Q13564 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NAE1Q13564 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NAE1Q13564 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NAE1Q13564 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
NAE1Q13564 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
NAE1Q13564 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
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NAE1Q13564 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NAE1Q13564 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NAE1Q13564 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NAE1Q13564 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NAE1Q13564 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NAE1Q13564 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NAE1Q13564 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NAE1Q13564 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NAE1Q13564 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NAE1Q13564 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NAE1Q13564 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NAE1Q13564 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NAE1Q13564 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NAE1Q13564 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NAE1Q13564 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NAE1Q13564 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms