Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPF4BQ13523 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRPF4BQ13523 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRPF4BQ13523 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
PRPF4BQ13523 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRPF4BQ13523 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRPF4BQ13523 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF4BQ13523 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF4BQ13523 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF4BQ13523 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF4BQ13523 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF4BQ13523 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF4BQ13523 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF4BQ13523 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF4BQ13523 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF4BQ13523 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF4BQ13523 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF4BQ13523 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
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