Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
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TUBB3Q13509 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBB3Q13509 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
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