Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PICALMQ13492 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PICALMQ13492 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PICALMQ13492 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PICALMQ13492 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PICALMQ13492 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PICALMQ13492 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PICALMQ13492 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PICALMQ13492 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PICALMQ13492 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PICALMQ13492 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PICALMQ13492 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PICALMQ13492 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PICALMQ13492 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PICALMQ13492 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PICALMQ13492 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PICALMQ13492 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PICALMQ13492 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PICALMQ13492 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PICALMQ13492 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PICALMQ13492 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PICALMQ13492 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PICALMQ13492 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PICALMQ13492 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PICALMQ13492 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PICALMQ13492 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PICALMQ13492 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PICALMQ13492 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PICALMQ13492 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PICALMQ13492 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PICALMQ13492 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PICALMQ13492 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PICALMQ13492 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PICALMQ13492 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PICALMQ13492 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PICALMQ13492 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PICALMQ13492 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PICALMQ13492 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PICALMQ13492 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PICALMQ13492 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PICALMQ13492 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PICALMQ13492 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PICALMQ13492 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PICALMQ13492 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PICALMQ13492 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PICALMQ13492 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PICALMQ13492 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PICALMQ13492 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PICALMQ13492 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PICALMQ13492 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PICALMQ13492 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PICALMQ13492 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PICALMQ13492 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PICALMQ13492 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PICALMQ13492 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PICALMQ13492 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PICALMQ13492 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PICALMQ13492 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PICALMQ13492 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PICALMQ13492 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PICALMQ13492 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PICALMQ13492 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PICALMQ13492 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PICALMQ13492 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PICALMQ13492 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PICALMQ13492 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PICALMQ13492 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PICALMQ13492 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PICALMQ13492 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PICALMQ13492 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PICALMQ13492 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PICALMQ13492 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PICALMQ13492 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PICALMQ13492 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PICALMQ13492 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PICALMQ13492 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PICALMQ13492 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PICALMQ13492 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PICALMQ13492 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PICALMQ13492 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PICALMQ13492 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PICALMQ13492 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PICALMQ13492 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PICALMQ13492 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PICALMQ13492 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PICALMQ13492 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PICALMQ13492 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PICALMQ13492 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PICALMQ13492 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PICALMQ13492 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PICALMQ13492 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PICALMQ13492 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PICALMQ13492 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PICALMQ13492 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PICALMQ13492 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PICALMQ13492 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PICALMQ13492 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PICALMQ13492 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PICALMQ13492 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PICALMQ13492 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
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