Protein–RNA interactions for Protein: Q13445

TMED1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED1Q13445 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TMED1Q13445 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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TMED1Q13445 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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TMED1Q13445 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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TMED1Q13445 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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TMED1Q13445 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TMED1Q13445 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
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