Protein–RNA interactions for Protein: Q13424

SNTA1, Alpha-1-syntrophin, humanhuman

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTA1Q13424 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNTA1Q13424 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
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