Protein–RNA interactions for Protein: Q13330

MTA1, Metastasis-associated protein MTA1, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA1Q13330 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
MTA1Q13330 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
MTA1Q13330 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
MTA1Q13330 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
MTA1Q13330 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
MTA1Q13330 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MTA1Q13330 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MTA1Q13330 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MTA1Q13330 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MTA1Q13330 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
MTA1Q13330 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MTA1Q13330 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MTA1Q13330 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MTA1Q13330 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MTA1Q13330 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MTA1Q13330 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MTA1Q13330 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MTA1Q13330 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MTA1Q13330 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MTA1Q13330 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MTA1Q13330 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MTA1Q13330 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MTA1Q13330 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MTA1Q13330 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MTA1Q13330 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MTA1Q13330 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MTA1Q13330 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MTA1Q13330 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MTA1Q13330 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MTA1Q13330 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
MTA1Q13330 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
MTA1Q13330 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
MTA1Q13330 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MTA1Q13330 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MTA1Q13330 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MTA1Q13330 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MTA1Q13330 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MTA1Q13330 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MTA1Q13330 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MTA1Q13330 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MTA1Q13330 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MTA1Q13330 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MTA1Q13330 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MTA1Q13330 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MTA1Q13330 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MTA1Q13330 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MTA1Q13330 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MTA1Q13330 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MTA1Q13330 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MTA1Q13330 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MTA1Q13330 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MTA1Q13330 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MTA1Q13330 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MTA1Q13330 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MTA1Q13330 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MTA1Q13330 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MTA1Q13330 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MTA1Q13330 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MTA1Q13330 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MTA1Q13330 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MTA1Q13330 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MTA1Q13330 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MTA1Q13330 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MTA1Q13330 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MTA1Q13330 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MTA1Q13330 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MTA1Q13330 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MTA1Q13330 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MTA1Q13330 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MTA1Q13330 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MTA1Q13330 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MTA1Q13330 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MTA1Q13330 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MTA1Q13330 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MTA1Q13330 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MTA1Q13330 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
MTA1Q13330 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MTA1Q13330 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MTA1Q13330 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MTA1Q13330 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MTA1Q13330 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MTA1Q13330 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MTA1Q13330 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MTA1Q13330 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MTA1Q13330 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MTA1Q13330 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MTA1Q13330 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MTA1Q13330 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MTA1Q13330 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MTA1Q13330 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MTA1Q13330 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MTA1Q13330 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MTA1Q13330 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MTA1Q13330 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
MTA1Q13330 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
MTA1Q13330 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MTA1Q13330 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MTA1Q13330 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MTA1Q13330 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MTA1Q13330 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
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