Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SKP2Q13309 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SKP2Q13309 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SKP2Q13309 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SKP2Q13309 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SKP2Q13309 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKP2Q13309 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKP2Q13309 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKP2Q13309 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKP2Q13309 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKP2Q13309 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKP2Q13309 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKP2Q13309 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKP2Q13309 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKP2Q13309 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKP2Q13309 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKP2Q13309 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKP2Q13309 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKP2Q13309 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SKP2Q13309 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKP2Q13309 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKP2Q13309 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKP2Q13309 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKP2Q13309 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKP2Q13309 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKP2Q13309 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKP2Q13309 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SKP2Q13309 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKP2Q13309 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKP2Q13309 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKP2Q13309 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKP2Q13309 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKP2Q13309 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKP2Q13309 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKP2Q13309 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKP2Q13309 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKP2Q13309 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKP2Q13309 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKP2Q13309 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKP2Q13309 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKP2Q13309 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKP2Q13309 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKP2Q13309 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKP2Q13309 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SKP2Q13309 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKP2Q13309 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKP2Q13309 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKP2Q13309 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKP2Q13309 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKP2Q13309 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKP2Q13309 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKP2Q13309 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKP2Q13309 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKP2Q13309 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKP2Q13309 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKP2Q13309 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKP2Q13309 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKP2Q13309 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKP2Q13309 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKP2Q13309 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKP2Q13309 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SKP2Q13309 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKP2Q13309 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKP2Q13309 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SKP2Q13309 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKP2Q13309 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKP2Q13309 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKP2Q13309 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKP2Q13309 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKP2Q13309 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKP2Q13309 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKP2Q13309 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKP2Q13309 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKP2Q13309 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKP2Q13309 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKP2Q13309 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKP2Q13309 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKP2Q13309 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKP2Q13309 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKP2Q13309 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKP2Q13309 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKP2Q13309 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKP2Q13309 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKP2Q13309 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKP2Q13309 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKP2Q13309 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SKP2Q13309 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKP2Q13309 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKP2Q13309 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKP2Q13309 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKP2Q13309 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
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