Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCGB2A2Q13296 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCGB2A2Q13296 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCGB2A2Q13296 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCGB2A2Q13296 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCGB2A2Q13296 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCGB2A2Q13296 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCGB2A2Q13296 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCGB2A2Q13296 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCGB2A2Q13296 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SCGB2A2Q13296 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SCGB2A2Q13296 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SCGB2A2Q13296 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SCGB2A2Q13296 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SCGB2A2Q13296 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SCGB2A2Q13296 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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SCGB2A2Q13296 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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SCGB2A2Q13296 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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SCGB2A2Q13296 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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SCGB2A2Q13296 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
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SCGB2A2Q13296 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCGB2A2Q13296 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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