Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

Predictions only

Length 1,484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
GRIN2BQ13224 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
GRIN2BQ13224 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
GRIN2BQ13224 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
GRIN2BQ13224 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
GRIN2BQ13224 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
GRIN2BQ13224 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
GRIN2BQ13224 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
GRIN2BQ13224 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
GRIN2BQ13224 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
GRIN2BQ13224 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
GRIN2BQ13224 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
GRIN2BQ13224 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
GRIN2BQ13224 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
GRIN2BQ13224 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
GRIN2BQ13224 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC33.39■■■□□ 2.94
GRIN2BQ13224 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
GRIN2BQ13224 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
GRIN2BQ13224 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
GRIN2BQ13224 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
GRIN2BQ13224 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
GRIN2BQ13224 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
GRIN2BQ13224 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
GRIN2BQ13224 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
GRIN2BQ13224 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.93
GRIN2BQ13224 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
GRIN2BQ13224 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
GRIN2BQ13224 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
GRIN2BQ13224 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
GRIN2BQ13224 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
GRIN2BQ13224 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
GRIN2BQ13224 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
GRIN2BQ13224 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
GRIN2BQ13224 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC33.38■■■□□ 2.93
GRIN2BQ13224 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
GRIN2BQ13224 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
GRIN2BQ13224 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
GRIN2BQ13224 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
GRIN2BQ13224 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
GRIN2BQ13224 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
GRIN2BQ13224 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
GRIN2BQ13224 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
GRIN2BQ13224 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
GRIN2BQ13224 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
GRIN2BQ13224 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
GRIN2BQ13224 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
GRIN2BQ13224 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
GRIN2BQ13224 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
GRIN2BQ13224 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
GRIN2BQ13224 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
GRIN2BQ13224 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
GRIN2BQ13224 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
GRIN2BQ13224 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
GRIN2BQ13224 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
GRIN2BQ13224 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
GRIN2BQ13224 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
GRIN2BQ13224 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
GRIN2BQ13224 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
GRIN2BQ13224 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
GRIN2BQ13224 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
GRIN2BQ13224 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
GRIN2BQ13224 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
GRIN2BQ13224 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
GRIN2BQ13224 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
GRIN2BQ13224 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
GRIN2BQ13224 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
GRIN2BQ13224 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
GRIN2BQ13224 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
GRIN2BQ13224 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC33.35■■■□□ 2.93
GRIN2BQ13224 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
GRIN2BQ13224 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
GRIN2BQ13224 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
GRIN2BQ13224 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
GRIN2BQ13224 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
GRIN2BQ13224 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
GRIN2BQ13224 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
GRIN2BQ13224 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
GRIN2BQ13224 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
GRIN2BQ13224 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
GRIN2BQ13224 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
GRIN2BQ13224 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
GRIN2BQ13224 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
GRIN2BQ13224 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
GRIN2BQ13224 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
GRIN2BQ13224 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
GRIN2BQ13224 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
GRIN2BQ13224 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
GRIN2BQ13224 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
GRIN2BQ13224 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
GRIN2BQ13224 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
GRIN2BQ13224 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
GRIN2BQ13224 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
GRIN2BQ13224 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
GRIN2BQ13224 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
GRIN2BQ13224 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
GRIN2BQ13224 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
GRIN2BQ13224 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
GRIN2BQ13224 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
GRIN2BQ13224 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
GRIN2BQ13224 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms