Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NR1H3Q13133 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NR1H3Q13133 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NR1H3Q13133 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NR1H3Q13133 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NR1H3Q13133 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NR1H3Q13133 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NR1H3Q13133 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NR1H3Q13133 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NR1H3Q13133 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NR1H3Q13133 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NR1H3Q13133 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NR1H3Q13133 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
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NR1H3Q13133 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NR1H3Q13133 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NR1H3Q13133 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NR1H3Q13133 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
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NR1H3Q13133 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NR1H3Q13133 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NR1H3Q13133 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
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NR1H3Q13133 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
NR1H3Q13133 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NR1H3Q13133 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
NR1H3Q13133 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NR1H3Q13133 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NR1H3Q13133 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NR1H3Q13133 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NR1H3Q13133 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NR1H3Q13133 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NR1H3Q13133 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NR1H3Q13133 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
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NR1H3Q13133 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NR1H3Q13133 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
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NR1H3Q13133 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NR1H3Q13133 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
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NR1H3Q13133 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
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NR1H3Q13133 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
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NR1H3Q13133 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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NR1H3Q13133 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NR1H3Q13133 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
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NR1H3Q13133 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
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NR1H3Q13133 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NR1H3Q13133 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NR1H3Q13133 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NR1H3Q13133 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NR1H3Q13133 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NR1H3Q13133 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NR1H3Q13133 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NR1H3Q13133 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NR1H3Q13133 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NR1H3Q13133 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NR1H3Q13133 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
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