Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IFT88Q13099 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IFT88Q13099 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
IFT88Q13099 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IFT88Q13099 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IFT88Q13099 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IFT88Q13099 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IFT88Q13099 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IFT88Q13099 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IFT88Q13099 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IFT88Q13099 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IFT88Q13099 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IFT88Q13099 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
IFT88Q13099 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IFT88Q13099 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IFT88Q13099 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IFT88Q13099 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IFT88Q13099 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IFT88Q13099 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IFT88Q13099 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
IFT88Q13099 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IFT88Q13099 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IFT88Q13099 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IFT88Q13099 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IFT88Q13099 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IFT88Q13099 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
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