Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIK3Q13003 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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