Protein–RNA interactions for Protein: Q12745

SEC39, Protein transport protein SEC39, yeastyeast

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEC39Q12745 YNL144CYNL144C 2223 nt1.93□□□□□ -2.1
SEC39Q12745 HER1YOR227W 3741 nt1.92□□□□□ -2.1
SEC39Q12745 YGL239CYGL239C 315 nt1.92□□□□□ -2.1
SEC39Q12745 YLR434CYLR434C 384 nt1.92□□□□□ -2.1
SEC39Q12745 YPL185WYPL185W 396 nt1.92□□□□□ -2.1
SEC39Q12745 IRC20YLR247C 4671 nt1.92□□□□□ -2.1
SEC39Q12745 ARP7YPR034W 1434 nt1.91□□□□□ -2.1
SEC39Q12745 HCS1YKL017C 2052 nt1.91□□□□□ -2.1
SEC39Q12745 YJR098CYJR098C 1971 nt1.91□□□□□ -2.1
SEC39Q12745 GNT1YOR320C 1476 nt1.91□□□□□ -2.1
SEC39Q12745 YDR118W-AYDR118W-A 117 nt1.91□□□□□ -2.1
SEC39Q12745 YER172C-AYER172C-A 381 nt1.91□□□□□ -2.1
SEC39Q12745 RPL42BYHR141C 321 nt1.91□□□□□ -2.1
SEC39Q12745 RPL42AYNL162W 321 nt1.91□□□□□ -2.1
SEC39Q12745 YOR146WYOR146W 306 nt1.91□□□□□ -2.1
SEC39Q12745 YOR293C-AYOR293C-A 150 nt1.91□□□□□ -2.1
SEC39Q12745 ZRG8YER033C 3231 nt1.9□□□□□ -2.11
SEC39Q12745 YCR102W-AYCR102W-A 198 nt1.9□□□□□ -2.11
SEC39Q12745 YPL182CYPL182C 384 nt1.9□□□□□ -2.11
SEC39Q12745 FAB1YFR019W 6837 nt1.9□□□□□ -2.11
SEC39Q12745 LHS1YKL073W 2646 nt1.9□□□□□ -2.11
SEC39Q12745 TOF2YKR010C 2316 nt1.89□□□□□ -2.11
SEC39Q12745 BTT1YDR252W 450 nt1.89□□□□□ -2.11
SEC39Q12745 WIP1YDR374W-A 270 nt1.89□□□□□ -2.11
SEC39Q12745 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt1.89□□□□□ -2.11
SEC39Q12745 YKL183C-AYKL183C-A 213 nt1.89□□□□□ -2.11
SEC39Q12745 CGI121YML036W 546 nt1.89□□□□□ -2.11
SEC39Q12745 DAS1YJL149W 1992 nt1.89□□□□□ -2.11
SEC39Q12745 YLR035C-AYLR035C-A 3468 nt1.88□□□□□ -2.11
SEC39Q12745 FIG2YCR089W 4830 nt1.88□□□□□ -2.11
SEC39Q12745 DNF3YMR162C 4971 nt1.88□□□□□ -2.11
SEC39Q12745 MYO4YAL029C 4416 nt1.87□□□□□ -2.11
SEC39Q12745 YAL068W-AYAL068W-A 255 nt1.87□□□□□ -2.11
SEC39Q12745 YAR047CYAR047C 321 nt1.87□□□□□ -2.11
SEC39Q12745 BSC3YLR465C 309 nt1.87□□□□□ -2.11
SEC39Q12745 RPL32YBL092W 393 nt1.87□□□□□ -2.11
SEC39Q12745 BPH1YCR032W 6504 nt1.87□□□□□ -2.11
SEC39Q12745 PEP1YBL017C 4740 nt1.87□□□□□ -2.11
SEC39Q12745 PKH3YDR466W 2697 nt1.86□□□□□ -2.11
SEC39Q12745 YPR170W-AYPR170W-A 186 nt1.86□□□□□ -2.11
SEC39Q12745 TDA9YML081W 3756 nt1.86□□□□□ -2.11
SEC39Q12745 HMRA1YCR097W 381 nt1.85□□□□□ -2.11
SEC39Q12745 YDL011CYDL011C 324 nt1.85□□□□□ -2.11
SEC39Q12745 YHR073W-AYHR073W-A 177 nt1.85□□□□□ -2.11
SEC39Q12745 PHS1YJL097W 654 nt1.85□□□□□ -2.11
SEC39Q12745 HIR3YJR140C 4947 nt1.84□□□□□ -2.11
SEC39Q12745 TIM13YGR181W 318 nt1.84□□□□□ -2.11
SEC39Q12745 MCM22YJR135C 720 nt1.84□□□□□ -2.11
SEC39Q12745 RPL9BYNL067W 576 nt1.84□□□□□ -2.11
SEC39Q12745 YNL114CYNL114C 372 nt1.84□□□□□ -2.11
SEC39Q12745 YPR012WYPR012W 255 nt1.84□□□□□ -2.11
SEC39Q12745 YJR039WYJR039W 3366 nt1.84□□□□□ -2.11
SEC39Q12745 YLR422WYLR422W 5799 nt1.84□□□□□ -2.12
SEC39Q12745 ADR1YDR216W 3972 nt1.83□□□□□ -2.12
SEC39Q12745 IRR1YIL026C 3453 nt1.83□□□□□ -2.12
SEC39Q12745 HSL1YKL101W 4557 nt1.83□□□□□ -2.12
SEC39Q12745 VPS34YLR240W 2628 nt1.83□□□□□ -2.12
SEC39Q12745 YDR008CYDR008C 351 nt1.83□□□□□ -2.12
SEC39Q12745 YER088C-AYER088C-A 324 nt1.83□□□□□ -2.12
SEC39Q12745 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt1.83□□□□□ -2.12
SEC39Q12745 VPS15YBR097W 4365 nt1.82□□□□□ -2.12
SEC39Q12745 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt1.82□□□□□ -2.12
SEC39Q12745 RPS27AYKL156W 249 nt1.82□□□□□ -2.12
SEC39Q12745 YLR334CYLR334C 381 nt1.82□□□□□ -2.12
SEC39Q12745 RPL26AYLR344W 384 nt1.82□□□□□ -2.12
SEC39Q12745 HCH1YNL281W 462 nt1.82□□□□□ -2.12
SEC39Q12745 YCL046WYCL046W 324 nt1.82□□□□□ -2.12
SEC39Q12745 HSH155YMR288W 2916 nt1.82□□□□□ -2.12
SEC39Q12745 YGR109W-BYGR109W-B 4644 nt1.82□□□□□ -2.12
SEC39Q12745 TFC8YPL007C 1767 nt1.81□□□□□ -2.12
SEC39Q12745 YAP6YDR259C 1152 nt1.81□□□□□ -2.12
SEC39Q12745 YER137W-AYER137W-A 306 nt1.81□□□□□ -2.12
SEC39Q12745 PAU18YLL064C 363 nt1.81□□□□□ -2.12
SEC39Q12745 PAU6YNR076W 363 nt1.81□□□□□ -2.12
SEC39Q12745 PCF11YDR228C 1881 nt1.81□□□□□ -2.12
SEC39Q12745 MSH6YDR097C 3729 nt1.8□□□□□ -2.12
SEC39Q12745 RKM1YPL208W 1752 nt1.8□□□□□ -2.12
SEC39Q12745 MSC6YOR354C 2079 nt1.8□□□□□ -2.12
SEC39Q12745 YBR174CYBR174C 315 nt1.8□□□□□ -2.12
SEC39Q12745 YGR250CYGR250C 2346 nt1.8□□□□□ -2.12
SEC39Q12745 SWI5YDR146C 2130 nt1.79□□□□□ -2.12
SEC39Q12745 YKL083WYKL083W 615 nt1.79□□□□□ -2.12
SEC39Q12745 ISF1YMR081C 1017 nt1.79□□□□□ -2.12
SEC39Q12745 YBL073WYBL073W 312 nt1.79□□□□□ -2.12
SEC39Q12745 FMP23YBR047W 528 nt1.79□□□□□ -2.12
SEC39Q12745 OSH6YKR003W 1347 nt1.79□□□□□ -2.12
SEC39Q12745 NUP192YJL039C 5052 nt1.79□□□□□ -2.12
SEC39Q12745 HDA3YPR179C 1968 nt1.79□□□□□ -2.12
SEC39Q12745 SEC63YOR254C 1992 nt1.78□□□□□ -2.12
SEC39Q12745 AIM9YER080W 1884 nt1.78□□□□□ -2.12
SEC39Q12745 IRA1YBR140C 9279 nt1.78□□□□□ -2.12
SEC39Q12745 IRE1YHR079C 3348 nt1.78□□□□□ -2.12
SEC39Q12745 SFB2YNL049C 2631 nt1.78□□□□□ -2.12
SEC39Q12745 KCS1YDR017C 3153 nt1.77□□□□□ -2.13
SEC39Q12745 snR56snR56 88 nt1.77□□□□□ -2.13
SEC39Q12745 YOR121CYOR121C 306 nt1.77□□□□□ -2.13
SEC39Q12745 SAR1YPL218W 573 nt1.77□□□□□ -2.13
SEC39Q12745 CTR9YOL145C 3234 nt1.77□□□□□ -2.13
SEC39Q12745 PMD1YER132C 5262 nt1.76□□□□□ -2.13
SEC39Q12745 SEY1YOR165W 2331 nt1.76□□□□□ -2.13
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 90.5 ms