Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNA1Q09470 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNA1Q09470 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNA1Q09470 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNA1Q09470 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNA1Q09470 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNA1Q09470 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNA1Q09470 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNA1Q09470 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNA1Q09470 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNA1Q09470 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNA1Q09470 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNA1Q09470 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNA1Q09470 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNA1Q09470 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNA1Q09470 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNA1Q09470 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNA1Q09470 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNA1Q09470 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNA1Q09470 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNA1Q09470 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNA1Q09470 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNA1Q09470 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNA1Q09470 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNA1Q09470 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNA1Q09470 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNA1Q09470 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNA1Q09470 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNA1Q09470 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNA1Q09470 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNA1Q09470 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNA1Q09470 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNA1Q09470 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNA1Q09470 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNA1Q09470 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNA1Q09470 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNA1Q09470 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNA1Q09470 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNA1Q09470 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNA1Q09470 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNA1Q09470 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNA1Q09470 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNA1Q09470 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNA1Q09470 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNA1Q09470 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNA1Q09470 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNA1Q09470 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNA1Q09470 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNA1Q09470 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNA1Q09470 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNA1Q09470 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNA1Q09470 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNA1Q09470 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNA1Q09470 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNA1Q09470 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNA1Q09470 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNA1Q09470 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNA1Q09470 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNA1Q09470 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNA1Q09470 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNA1Q09470 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNA1Q09470 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNA1Q09470 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNA1Q09470 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNA1Q09470 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNA1Q09470 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNA1Q09470 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNA1Q09470 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNA1Q09470 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNA1Q09470 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNA1Q09470 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNA1Q09470 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNA1Q09470 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNA1Q09470 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNA1Q09470 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNA1Q09470 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNA1Q09470 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNA1Q09470 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNA1Q09470 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
KCNA1Q09470 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
KCNA1Q09470 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNA1Q09470 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNA1Q09470 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNA1Q09470 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNA1Q09470 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNA1Q09470 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNA1Q09470 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNA1Q09470 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNA1Q09470 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNA1Q09470 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNA1Q09470 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNA1Q09470 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNA1Q09470 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNA1Q09470 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNA1Q09470 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNA1Q09470 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNA1Q09470 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNA1Q09470 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNA1Q09470 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNA1Q09470 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms