Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
FAM27E3Q08E93 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FAM27E3Q08E93 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms