Protein–RNA interactions for Protein: Q08474

VAM10, Vacuolar morphogenesis protein 10, yeastyeast

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VAM10Q08474 YOL106WYOL106W 354 nt0.57□□□□□ -2.32
VAM10Q08474 YFL002W-BYFL002W-B 1317 nt0.57□□□□□ -2.32
VAM10Q08474 YGR161W-AYGR161W-A 1317 nt0.57□□□□□ -2.32
VAM10Q08474 YBL100W-AYBL100W-A 1317 nt0.57□□□□□ -2.32
VAM10Q08474 YOR192C-AYOR192C-A 1317 nt0.57□□□□□ -2.32
VAM10Q08474 YCL020WYCL020W 1317 nt0.57□□□□□ -2.32
VAM10Q08474 SAG1YJR004C 1953 nt0.56□□□□□ -2.32
VAM10Q08474 YDL152WYDL152W 366 nt0.56□□□□□ -2.32
VAM10Q08474 PRM8YGL053W 714 nt0.56□□□□□ -2.32
VAM10Q08474 SMD3YLR147C 306 nt0.56□□□□□ -2.32
VAM10Q08474 SWS2YNL081C 432 nt0.56□□□□□ -2.32
VAM10Q08474 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt0.55□□□□□ -2.32
VAM10Q08474 YDR521WYDR521W 336 nt0.55□□□□□ -2.32
VAM10Q08474 YML009C-AYML009C-A 327 nt0.55□□□□□ -2.32
VAM10Q08474 CMC4YMR194C-B 222 nt0.55□□□□□ -2.32
VAM10Q08474 RPS30BYOR182C 192 nt0.55□□□□□ -2.32
VAM10Q08474 UTP20YBL004W 7482 nt0.55□□□□□ -2.32
VAM10Q08474 HDA3YPR179C 1968 nt0.55□□□□□ -2.32
VAM10Q08474 SEC1YDR164C 2175 nt0.55□□□□□ -2.32
VAM10Q08474 AIM9YER080W 1884 nt0.54□□□□□ -2.32
VAM10Q08474 RRI2YOL117W 1938 nt0.54□□□□□ -2.32
VAM10Q08474 NUP157YER105C 4176 nt0.54□□□□□ -2.32
VAM10Q08474 SRP14YDL092W 441 nt0.54□□□□□ -2.32
VAM10Q08474 YGR045CYGR045C 363 nt0.54□□□□□ -2.32
VAM10Q08474 SLX9YGR081C 633 nt0.54□□□□□ -2.32
VAM10Q08474 NBP1YLR457C 960 nt0.54□□□□□ -2.32
VAM10Q08474 YBL029C-AYBL029C-A 285 nt0.54□□□□□ -2.32
VAM10Q08474 YNL150WYNL150W 408 nt0.54□□□□□ -2.32
VAM10Q08474 UBS1YBR165W 834 nt0.54□□□□□ -2.32
VAM10Q08474 PAC1YOR269W 1485 nt0.54□□□□□ -2.32
VAM10Q08474 GPM2YDL021W 936 nt0.53□□□□□ -2.32
VAM10Q08474 NHP2YDL208W 471 nt0.53□□□□□ -2.32
VAM10Q08474 CYC7YEL039C 342 nt0.53□□□□□ -2.32
VAM10Q08474 SMB1YER029C 591 nt0.53□□□□□ -2.32
VAM10Q08474 YFR057WYFR057W 456 nt0.53□□□□□ -2.32
VAM10Q08474 RSM27YGR215W 333 nt0.53□□□□□ -2.32
VAM10Q08474 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt0.53□□□□□ -2.32
VAM10Q08474 RPL16AYIL133C 600 nt0.53□□□□□ -2.32
VAM10Q08474 INA22YIR024C 651 nt0.53□□□□□ -2.32
VAM10Q08474 YMR013C-AYMR013C-A 150 nt0.53□□□□□ -2.32
VAM10Q08474 YOP1YPR028W 543 nt0.53□□□□□ -2.32
VAM10Q08474 OST1YJL002C 1431 nt0.53□□□□□ -2.32
VAM10Q08474 YMR160WYMR160W 2451 nt0.52□□□□□ -2.33
VAM10Q08474 MRPL32YCR003W 552 nt0.52□□□□□ -2.33
VAM10Q08474 snR79snR79 84 nt0.52□□□□□ -2.33
VAM10Q08474 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.52□□□□□ -2.33
VAM10Q08474 LRP1YHR081W 555 nt0.52□□□□□ -2.33
VAM10Q08474 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.52□□□□□ -2.33
VAM10Q08474 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.52□□□□□ -2.33
VAM10Q08474 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.52□□□□□ -2.33
VAM10Q08474 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.52□□□□□ -2.33
VAM10Q08474 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.52□□□□□ -2.33
VAM10Q08474 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.52□□□□□ -2.33
VAM10Q08474 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.52□□□□□ -2.33
VAM10Q08474 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.52□□□□□ -2.33
VAM10Q08474 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.52□□□□□ -2.33
VAM10Q08474 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.52□□□□□ -2.33
VAM10Q08474 YIR021W-AYIR021W-A 213 nt0.52□□□□□ -2.33
VAM10Q08474 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt0.52□□□□□ -2.33
VAM10Q08474 COX7YMR256C 183 nt0.52□□□□□ -2.33
VAM10Q08474 YBR012CYBR012C 420 nt0.52□□□□□ -2.33
VAM10Q08474 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt0.52□□□□□ -2.33
VAM10Q08474 SET3YKR029C 2256 nt0.52□□□□□ -2.33
VAM10Q08474 TOF2YKR010C 2316 nt0.52□□□□□ -2.33
VAM10Q08474 QCR7YDR529C 384 nt0.51□□□□□ -2.33
VAM10Q08474 SPC2YML055W 537 nt0.51□□□□□ -2.33
VAM10Q08474 RUF22RUF22 515 nt0.51□□□□□ -2.33
VAM10Q08474 RKR1YMR247C 4689 nt0.5□□□□□ -2.33
VAM10Q08474 KAR1YNL188W 1302 nt0.5□□□□□ -2.33
VAM10Q08474 ZIP1YDR285W 2628 nt0.5□□□□□ -2.33
VAM10Q08474 MPT5YGL178W 2580 nt0.5□□□□□ -2.33
VAM10Q08474 YDR509WYDR509W 348 nt0.5□□□□□ -2.33
VAM10Q08474 YER023C-AYER023C-A 213 nt0.5□□□□□ -2.33
VAM10Q08474 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt0.5□□□□□ -2.33
VAM10Q08474 NUT2YPR168W 474 nt0.5□□□□□ -2.33
VAM10Q08474 NOC3YLR002C 1992 nt0.5□□□□□ -2.33
VAM10Q08474 UTP13YLR222C 2454 nt0.49□□□□□ -2.33
VAM10Q08474 SLD3YGL113W 2007 nt0.49□□□□□ -2.33
VAM10Q08474 PIG1YLR273C 1947 nt0.49□□□□□ -2.33
VAM10Q08474 SWF1YDR126W 1011 nt0.49□□□□□ -2.33
VAM10Q08474 TAD1YGL243W 1203 nt0.49□□□□□ -2.33
VAM10Q08474 YAP3YHL009C 993 nt0.49□□□□□ -2.33
VAM10Q08474 TIM10YHR005C-A 282 nt0.49□□□□□ -2.33
VAM10Q08474 RPC10YHR143W-A 213 nt0.49□□□□□ -2.33
VAM10Q08474 HIT1YJR055W 495 nt0.49□□□□□ -2.33
VAM10Q08474 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt0.49□□□□□ -2.33
VAM10Q08474 YPL197CYPL197C 414 nt0.49□□□□□ -2.33
VAM10Q08474 POP7YBR167C 423 nt0.49□□□□□ -2.33
VAM10Q08474 SWI5YDR146C 2130 nt0.49□□□□□ -2.33
VAM10Q08474 RIM20YOR275C 1986 nt0.48□□□□□ -2.33
VAM10Q08474 YDL196WYDL196W 330 nt0.48□□□□□ -2.33
VAM10Q08474 YDR008CYDR008C 351 nt0.48□□□□□ -2.33
VAM10Q08474 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.48□□□□□ -2.33
VAM10Q08474 VAM3YOR106W 852 nt0.48□□□□□ -2.33
VAM10Q08474 YOR199WYOR199W 330 nt0.48□□□□□ -2.33
VAM10Q08474 YJR003CYJR003C 1560 nt0.48□□□□□ -2.33
VAM10Q08474 AIM44YPL158C 2277 nt0.48□□□□□ -2.33
VAM10Q08474 ENV11YGR071C 2583 nt0.47□□□□□ -2.33
VAM10Q08474 MXR1YER042W 555 nt0.47□□□□□ -2.33
VAM10Q08474 YNL146C-AYNL146C-A 195 nt0.47□□□□□ -2.33
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