Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TGM3Q08188 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms