Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms