Protein–RNA interactions for Protein: Q07879

ATG10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, yeastyeast

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG10Q07879 YPR172WYPR172W 603 nt0.69□□□□□ -2.3
ATG10Q07879 YBR184WYBR184W 1572 nt0.69□□□□□ -2.3
ATG10Q07879 SWI4YER111C 3282 nt0.69□□□□□ -2.3
ATG10Q07879 CHZ1YER030W 462 nt0.68□□□□□ -2.3
ATG10Q07879 TDA2YER071C 381 nt0.68□□□□□ -2.3
ATG10Q07879 COX3Q0275 810 nt0.68□□□□□ -2.3
ATG10Q07879 CMC1YKL137W 336 nt0.68□□□□□ -2.3
ATG10Q07879 YBL062WYBL062W 381 nt0.68□□□□□ -2.3
ATG10Q07879 YBL068W-AYBL068W-A 237 nt0.68□□□□□ -2.3
ATG10Q07879 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt0.68□□□□□ -2.3
ATG10Q07879 YPL080CYPL080C 327 nt0.68□□□□□ -2.3
ATG10Q07879 YPR117WYPR117W 7470 nt0.68□□□□□ -2.3
ATG10Q07879 SWT1YOR166C 1377 nt0.68□□□□□ -2.3
ATG10Q07879 KAP120YPL125W 3099 nt0.68□□□□□ -2.3
ATG10Q07879 GDS1YOR355W 1569 nt0.67□□□□□ -2.3
ATG10Q07879 BUD26YDR241W 288 nt0.67□□□□□ -2.3
ATG10Q07879 YER087C-AYER087C-A 552 nt0.67□□□□□ -2.3
ATG10Q07879 IES5YER092W 378 nt0.67□□□□□ -2.3
ATG10Q07879 URM1YIL008W 300 nt0.67□□□□□ -2.3
ATG10Q07879 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.67□□□□□ -2.3
ATG10Q07879 SPT21YMR179W 2277 nt0.67□□□□□ -2.3
ATG10Q07879 SAS3YBL052C 2496 nt0.66□□□□□ -2.3
ATG10Q07879 SWS2YNL081C 432 nt0.66□□□□□ -2.3
ATG10Q07879 YBL073WYBL073W 312 nt0.66□□□□□ -2.3
ATG10Q07879 YDR034C-CYDR034C-C 1317 nt0.65□□□□□ -2.3
ATG10Q07879 YFL002W-BYFL002W-B 1317 nt0.65□□□□□ -2.3
ATG10Q07879 YGR161W-AYGR161W-A 1317 nt0.65□□□□□ -2.3
ATG10Q07879 YLR410W-AYLR410W-A 1317 nt0.65□□□□□ -2.3
ATG10Q07879 YBL100W-AYBL100W-A 1317 nt0.65□□□□□ -2.3
ATG10Q07879 YOR192C-AYOR192C-A 1317 nt0.65□□□□□ -2.3
ATG10Q07879 YCL020WYCL020W 1317 nt0.65□□□□□ -2.3
ATG10Q07879 UTP20YBL004W 7482 nt0.65□□□□□ -2.3
ATG10Q07879 APL3YBL037W 3078 nt0.65□□□□□ -2.31
ATG10Q07879 YER158W-AYER158W-A 216 nt0.65□□□□□ -2.31
ATG10Q07879 ACF4YJR083C 930 nt0.65□□□□□ -2.31
ATG10Q07879 RPL37AYLR185W 267 nt0.65□□□□□ -2.31
ATG10Q07879 ISF1YMR081C 1017 nt0.65□□□□□ -2.31
ATG10Q07879 ATP20YPR020W 348 nt0.65□□□□□ -2.31
ATG10Q07879 AIM9YER080W 1884 nt0.65□□□□□ -2.31
ATG10Q07879 CMS1YLR003C 876 nt0.64□□□□□ -2.31
ATG10Q07879 YOR364WYOR364W 369 nt0.64□□□□□ -2.31
ATG10Q07879 SET3YKR029C 2256 nt0.63□□□□□ -2.31
ATG10Q07879 SPO13YHR014W 876 nt0.63□□□□□ -2.31
ATG10Q07879 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.63□□□□□ -2.31
ATG10Q07879 RRI2YOL117W 1938 nt0.62□□□□□ -2.31
ATG10Q07879 SRP14YDL092W 441 nt0.62□□□□□ -2.31
ATG10Q07879 WIP1YDR374W-A 270 nt0.62□□□□□ -2.31
ATG10Q07879 YCS4YLR272C 3531 nt0.61□□□□□ -2.31
ATG10Q07879 CYC7YEL039C 342 nt0.61□□□□□ -2.31
ATG10Q07879 PRM8YGL053W 714 nt0.61□□□□□ -2.31
ATG10Q07879 LIN1YHR156C 1023 nt0.61□□□□□ -2.31
ATG10Q07879 SMD3YLR147C 306 nt0.61□□□□□ -2.31
ATG10Q07879 COX7YMR256C 183 nt0.61□□□□□ -2.31
ATG10Q07879 YMR304C-AYMR304C-A 351 nt0.61□□□□□ -2.31
ATG10Q07879 YOL106WYOL106W 354 nt0.61□□□□□ -2.31
ATG10Q07879 VPS52YDR484W 1926 nt0.61□□□□□ -2.31
ATG10Q07879 HDA3YPR179C 1968 nt0.6□□□□□ -2.31
ATG10Q07879 VMA7YGR020C 357 nt0.6□□□□□ -2.31
ATG10Q07879 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt0.6□□□□□ -2.31
ATG10Q07879 YNL150WYNL150W 408 nt0.6□□□□□ -2.31
ATG10Q07879 TOF2YKR010C 2316 nt0.6□□□□□ -2.31
ATG10Q07879 snR79snR79 84 nt0.59□□□□□ -2.31
ATG10Q07879 NBL1YHR199C-A 222 nt0.59□□□□□ -2.31
ATG10Q07879 YLR217WYLR217W 324 nt0.59□□□□□ -2.31
ATG10Q07879 NBP1YLR457C 960 nt0.59□□□□□ -2.31
ATG10Q07879 YOR218CYOR218C 420 nt0.59□□□□□ -2.31
ATG10Q07879 SWI6YLR182W 2412 nt0.58□□□□□ -2.32
ATG10Q07879 NUP120YKL057C 3114 nt0.58□□□□□ -2.32
ATG10Q07879 UTP13YLR222C 2454 nt0.58□□□□□ -2.32
ATG10Q07879 CWC23YGL128C 852 nt0.58□□□□□ -2.32
ATG10Q07879 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt0.58□□□□□ -2.32
ATG10Q07879 MPT5YGL178W 2580 nt0.58□□□□□ -2.32
ATG10Q07879 SAG1YJR004C 1953 nt0.57□□□□□ -2.32
ATG10Q07879 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt0.57□□□□□ -2.32
ATG10Q07879 YAP3YHL009C 993 nt0.57□□□□□ -2.32
ATG10Q07879 YOP1YPR028W 543 nt0.57□□□□□ -2.32
ATG10Q07879 ZIP1YDR285W 2628 nt0.57□□□□□ -2.32
ATG10Q07879 NOC3YLR002C 1992 nt0.57□□□□□ -2.32
ATG10Q07879 SWI5YDR146C 2130 nt0.56□□□□□ -2.32
ATG10Q07879 SMB1YER029C 591 nt0.56□□□□□ -2.32
ATG10Q07879 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt0.56□□□□□ -2.32
ATG10Q07879 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt0.56□□□□□ -2.32
ATG10Q07879 NUT1YGL151W 3399 nt0.55□□□□□ -2.32
ATG10Q07879 RKR1YMR247C 4689 nt0.55□□□□□ -2.32
ATG10Q07879 YHR054CYHR054C 1065 nt0.55□□□□□ -2.32
ATG10Q07879 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt0.55□□□□□ -2.32
ATG10Q07879 YBR012CYBR012C 420 nt0.55□□□□□ -2.32
ATG10Q07879 NUT2YPR168W 474 nt0.55□□□□□ -2.32
ATG10Q07879 HNT1YDL125C 477 nt0.54□□□□□ -2.32
ATG10Q07879 MXR1YER042W 555 nt0.54□□□□□ -2.32
ATG10Q07879 LRP1YHR081W 555 nt0.54□□□□□ -2.32
ATG10Q07879 RIM20YOR275C 1986 nt0.54□□□□□ -2.32
ATG10Q07879 YDL206WYDL206W 2289 nt0.53□□□□□ -2.32
ATG10Q07879 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt0.53□□□□□ -2.32
ATG10Q07879 YMR013C-AYMR013C-A 150 nt0.53□□□□□ -2.32
ATG10Q07879 YPR170CYPR170C 336 nt0.53□□□□□ -2.32
ATG10Q07879 UBS1YBR165W 834 nt0.53□□□□□ -2.32
ATG10Q07879 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt0.53□□□□□ -2.32
ATG10Q07879 PIG1YLR273C 1947 nt0.52□□□□□ -2.33
ATG10Q07879 UTP10YJL109C 5310 nt0.52□□□□□ -2.33
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 29.8 ms