Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDE4BQ07343 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDE4BQ07343 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDE4BQ07343 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDE4BQ07343 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDE4BQ07343 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDE4BQ07343 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PDE4BQ07343 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDE4BQ07343 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDE4BQ07343 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDE4BQ07343 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PDE4BQ07343 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDE4BQ07343 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDE4BQ07343 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDE4BQ07343 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDE4BQ07343 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDE4BQ07343 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDE4BQ07343 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDE4BQ07343 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDE4BQ07343 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE4BQ07343 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE4BQ07343 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE4BQ07343 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE4BQ07343 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE4BQ07343 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE4BQ07343 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE4BQ07343 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE4BQ07343 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE4BQ07343 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE4BQ07343 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE4BQ07343 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE4BQ07343 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE4BQ07343 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE4BQ07343 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE4BQ07343 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE4BQ07343 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE4BQ07343 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE4BQ07343 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE4BQ07343 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE4BQ07343 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE4BQ07343 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDE4BQ07343 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDE4BQ07343 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDE4BQ07343 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDE4BQ07343 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDE4BQ07343 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDE4BQ07343 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDE4BQ07343 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDE4BQ07343 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDE4BQ07343 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDE4BQ07343 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PDE4BQ07343 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDE4BQ07343 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDE4BQ07343 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDE4BQ07343 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDE4BQ07343 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDE4BQ07343 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PDE4BQ07343 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PDE4BQ07343 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PDE4BQ07343 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDE4BQ07343 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms