Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
EXOSC9Q06265 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
EXOSC9Q06265 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EXOSC9Q06265 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EXOSC9Q06265 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
EXOSC9Q06265 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
EXOSC9Q06265 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
EXOSC9Q06265 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EXOSC9Q06265 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
EXOSC9Q06265 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
EXOSC9Q06265 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EXOSC9Q06265 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EXOSC9Q06265 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EXOSC9Q06265 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EXOSC9Q06265 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EXOSC9Q06265 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EXOSC9Q06265 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EXOSC9Q06265 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EXOSC9Q06265 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EXOSC9Q06265 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
EXOSC9Q06265 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
EXOSC9Q06265 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EXOSC9Q06265 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EXOSC9Q06265 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EXOSC9Q06265 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EXOSC9Q06265 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EXOSC9Q06265 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EXOSC9Q06265 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EXOSC9Q06265 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EXOSC9Q06265 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
EXOSC9Q06265 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EXOSC9Q06265 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EXOSC9Q06265 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EXOSC9Q06265 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EXOSC9Q06265 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EXOSC9Q06265 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EXOSC9Q06265 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EXOSC9Q06265 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EXOSC9Q06265 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EXOSC9Q06265 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EXOSC9Q06265 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EXOSC9Q06265 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EXOSC9Q06265 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EXOSC9Q06265 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EXOSC9Q06265 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EXOSC9Q06265 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EXOSC9Q06265 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EXOSC9Q06265 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EXOSC9Q06265 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EXOSC9Q06265 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EXOSC9Q06265 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EXOSC9Q06265 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EXOSC9Q06265 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EXOSC9Q06265 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EXOSC9Q06265 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EXOSC9Q06265 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EXOSC9Q06265 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
EXOSC9Q06265 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EXOSC9Q06265 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EXOSC9Q06265 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
EXOSC9Q06265 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EXOSC9Q06265 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
EXOSC9Q06265 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EXOSC9Q06265 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
EXOSC9Q06265 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EXOSC9Q06265 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EXOSC9Q06265 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EXOSC9Q06265 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EXOSC9Q06265 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EXOSC9Q06265 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EXOSC9Q06265 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EXOSC9Q06265 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EXOSC9Q06265 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EXOSC9Q06265 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EXOSC9Q06265 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EXOSC9Q06265 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EXOSC9Q06265 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EXOSC9Q06265 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EXOSC9Q06265 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EXOSC9Q06265 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EXOSC9Q06265 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EXOSC9Q06265 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EXOSC9Q06265 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EXOSC9Q06265 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EXOSC9Q06265 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EXOSC9Q06265 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EXOSC9Q06265 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EXOSC9Q06265 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
EXOSC9Q06265 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EXOSC9Q06265 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EXOSC9Q06265 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EXOSC9Q06265 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
EXOSC9Q06265 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EXOSC9Q06265 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
EXOSC9Q06265 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
EXOSC9Q06265 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
EXOSC9Q06265 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
EXOSC9Q06265 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
EXOSC9Q06265 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EXOSC9Q06265 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms