Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN11Q06124 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN11Q06124 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN11Q06124 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN11Q06124 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN11Q06124 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN11Q06124 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN11Q06124 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN11Q06124 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN11Q06124 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN11Q06124 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN11Q06124 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN11Q06124 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN11Q06124 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN11Q06124 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPN11Q06124 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPN11Q06124 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPN11Q06124 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPN11Q06124 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPN11Q06124 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPN11Q06124 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPN11Q06124 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPN11Q06124 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPN11Q06124 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPN11Q06124 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPN11Q06124 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPN11Q06124 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPN11Q06124 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPN11Q06124 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPN11Q06124 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPN11Q06124 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPN11Q06124 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPN11Q06124 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPN11Q06124 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPN11Q06124 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPN11Q06124 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPN11Q06124 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPN11Q06124 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPN11Q06124 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPN11Q06124 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPN11Q06124 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPN11Q06124 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN11Q06124 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN11Q06124 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN11Q06124 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN11Q06124 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN11Q06124 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN11Q06124 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN11Q06124 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN11Q06124 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN11Q06124 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN11Q06124 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN11Q06124 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN11Q06124 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN11Q06124 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN11Q06124 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN11Q06124 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PTPN11Q06124 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN11Q06124 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN11Q06124 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN11Q06124 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN11Q06124 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN11Q06124 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN11Q06124 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN11Q06124 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN11Q06124 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN11Q06124 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN11Q06124 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN11Q06124 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN11Q06124 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPN11Q06124 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPN11Q06124 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPN11Q06124 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPN11Q06124 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPN11Q06124 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPN11Q06124 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPN11Q06124 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPN11Q06124 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPN11Q06124 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPN11Q06124 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPN11Q06124 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPN11Q06124 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPN11Q06124 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPN11Q06124 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPN11Q06124 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPN11Q06124 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPN11Q06124 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN11Q06124 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN11Q06124 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN11Q06124 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN11Q06124 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN11Q06124 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN11Q06124 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN11Q06124 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN11Q06124 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN11Q06124 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN11Q06124 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN11Q06124 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN11Q06124 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN11Q06124 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms